С 28 июня 1996 года до июля 2000 года М.С. Нарикбаев занимал должность Председателя Верховного суда РК. В этот период он возглавлял реформы в судебной системе. Под его руководством совершенствовалось законодательство, касающееся судебной системы и статуса судей, принимались меры по улучшению материально-технического состояния судов и укреплению роли судебной власти в системе разделения властей, разрабатывались меры по усилению статуса и независимости судей, по снижению их рабочей нагрузки. Верховный суд был передислоцирован и начал работу в новой столице. Важным направлением работы была институционализация судейского сообщества. В декабре 1996 г. прошел I съезд судей Казахстана, а также были созданы Союз судей Казахстана и его постоянные органы, вышел первый номер журнала Союза судей «Тура би». В период работы Максута Султановича в должности председателя Верховного Суда РК представители судебной системы смогли в полной мере ощутить заботу государства, которая в том числе проявлялась в повышении статуса судей. Сегодня тот факт, что судьи материально обеспечены и получают достойную заработную плату, — это без преувеличения одна из заслуг М.С. Нарикбаева, стремившегося исключить влияние коррупционных факторов на судебную систему республики. Именно он предложил ввести принцип начисления окладов судей в процентном соотношении к заработной плате председателя Верховного Суда.

На законодательном уровне нашли решение такие вопросы, как создание института присяжных заседателей, создание ювенальных, налоговых и других специализированных судов, обеспечение защиты судей, свидетелей и потерпевших, усиление судебного контроля, разграничение отправления правосудия от судебного администрирования.

Максут Султанович сыграл ключевую роль в формировании судебной системы как самостоятельной и независимой ветви власти. Его личное участие существенно поспособствовало созданию независимого и действенного правосудия.

Следует также отметить, что Максут Султанович является сторонником внедрения в Казахстане института мировых судей. По его мнению, в этом вопросе можно опираться на опыт отечественной истории, в частности на широко известный суд биев. Бии избирались населением региона для рассмотрения и разрешения разного рода несложных и не представляющих повышенной социальной опасности дел. Основной функцией биев было примирение сторон, а не лишение человека свободы. Сегодня этот вопрос становится актуальным и целесообразным, так как в судопроизводство внедряются примирительные процедуры, которые могли бы разрешать споры и при этом доводить дело до суда.

По инициативе и при участии Максута Султановича был создан проект памятника трем знаменитым казахским биям XVIII века — Толе би, Казыбек би и Айтеке би, который установлен у первого здания Верховного суда в столице. Впоследствии по его предложению в КазГЮУ была учреждена стипендия имени Трех биев, а также одна из аудиторий университета получила название в честь великих казахских деятелей.

В период, когда М. Нарикбаев возглавлял Верховный Суд республики, в законодательство о судебной власти были внедрены общепризнанные принципы международного права, а также закреплены основы обеспечения независимости судей при осуществлении правосудия.

М. Нарикбаев не раз подчеркивал, что самое главное наряду с независимостью судей - это обеспечение строгой подотчетности их деятельности государству и обществу.

Главы