Ол тек жоғары кәсіби деңгейдегі мемлекеттік қызметкер ғана емес, сонымен қатар белсенді қоғам қайраткері, саяси партия жетекшісі және ғылыми-публицистикалық еңбектердің авторы болды. Ұйымдастырушылық қабілетінің арқасында Мақсұт Нәрікбаев 1995 жылдың 6 қазандағы Президент Жарлығымен Қазақстан Республикасының Бас прокуроры болып тағайындалды.

Жаңа Конституция қабылданғаннан кейін прокуратура қызметінің тұжырымдамасы айтарлықтай өзгерістерге ұшырады. М.С.Нәрікбаевтың басшылығымен реформалау басталып,прокуратура функцияларының өзгеруіне әкелді. Тергеу жаңа мемлекеттік орган — Мемлекеттік тергеу комитетіне (МТК) берілді. Реформа шеңберінде Бас прокуратураның құрылымын қайта ұйымдастыру жүргізіліп, азаматтардың құқықтары мен бостандықтарының сақталуын қадағалаумен, сондай-ақ жедел-іздестіру қызметі мен әкімшілік іс жүргізудің заңдылығын бақылаумен айналысатын жаңа бөлімшелер құрылды. Облыстық прокуратуралардың басқару аппараттарының құрылымын қайта қарау нәтижесінде олардың Штаттарының бір бөлігін қалалық және аудандық бөлімшелерге беру мүмкіндігі қарастырылды.

Сондай-ақ, Бас прокуратура аппаратының құрылымын қайта құру жүргізіліп, кәмелетке толмағандар арасындағы қылмысқа тиімдірек қарсы тұруға мүмкіндік берді. Осыған байланысты кәмелетке толмағандар жөніндегі мамандандырылған бөлімшелер қайта құрылды.

Прокуратура жұмысының тұжырымдамасы негізгі өзгеріске ұшырады: ол тек мемлекеттік айыптаушы және мемлекет мүддесін қорғаушы ретінде ғана емес, сонымен қатар заңның, жеке және заңды тұлғалардың құқықтары мен бостандықтарының, сондай-ақ заңның орындалуын қадағалайтын органның адвокаты ретінде де әрекет етуі керек еді. Бұл прокуратура қызметкерлерінде ғана емес, құқықтық қатынастардың барлық қатысушыларында да жаңа құқықтық мәдениет пен ойлау үлгісін қайта қарауды, тәрбиелеуді және қалыптастыруды талап етті.